Скорее всего эта фамилия имеет византийские корни, а после принятия христианства на территории Малой Азии, где оставались многонациональные населения, фамилия привела к армянской огласовке. Итак вначале появилась фамилия Барбарян, которая, кстати, сейчас очень распространена в Армении и переводится как сын бородатого, а потом уже было оформлено суффиксом "ов", характерным для русских фамилий.