Мир энциклопедий

Действительно, работа проделана огромная.
Однако лично я ничего "невнятного" в структуре сайта не нахожу: она по-моему, в принципе, мало чем отличается, например, от Вики. А если мы не "догадываемся",  в каком разделе искать конкретный объект, можно открыть общий словник или в конце-концов воспользоваться поиском по сайту.

Приятный сайт с обилием хорошей и четкой информации. Я бы немного изменил внешний вид главной страницы следующим образом:
1. Слова : "открытая... — проект.." выделил бы другим цветом, чтобы входящему сразу бросалось в глаза, что это собственно за проект. И он сразу же не убежал бы,  подумав, что это очередная "завлекаловка". Так же, если есть благословение кого-то из духовных лиц, необходимо указать.
2. Форум и популярные статьи также вынес бы вверх страницы: в новом проекте главное, чтобы сразу на входе привлечь читателя.
3. Внес бы статью — "это интересно", так же выделив цветом, где, предположим, можно было бы давать малоизвестные факты из жизни церкви или святых. Например, когда после службы в храме Иоанн Грозный встретился с Василием Блаженным и был обличен последним за то, что на службе думал не о Боге, а о новой стройке на Воробьевых горах... Ну и тому подобное... Удачи проекту и поклон его создателям!

Та же Вики работает благодаря многочисленным волонтерам...  
Думаю, что имеет смысл войти во взаимодействие с другими православными сайтами, а еще лучше — с воскресными школами, где много молодых ребят могли бы Вам помочь. Они и в интернете сидят, и газеты выпускают: с огромным удовольствием напишут Вам новостей — каждый о своем городе или приходе.
Да и сами священнослужители будут рады поотвечать на различные вопросы и что-то посоветовать.