Мир энциклопедий

От ивритского (древнееврейского) "Маргалит" — жемчуг.
Интересно, что в таком виде европейские средневековые евреи-ашкенази заимствовали слово "Маргарита". То есть взяли слово и изменили на свой лад, придав ему "родное значение". Так оно и прижилось. А поскольку происхождение матери у евреев было очень почетным, то и фамилии часто давались по имени матери (а не по отцу, как у русских и многих других народов).