Я думаю, вы неправы по поводу ударения! Происхождение этой фамилии (как и родственных ей Воинова, Воинов) связано с существованием в старину и мирского имени Воин — значение его более понятно из такого же прозвища.
Более того, вспоминаем святых с прозвищем Иван Воин, Зосима Воин, Федор Воин, Дмитрий Воин или Стратилат. Возможно, таким именем святого и нарекали младенцев, сделав старорусское имя Воин как бы крестильным, каноническим. Уменьшительное от него — Война, так и родилась фамилия Война.
Более того, вспоминаем святых с прозвищем Иван Воин, Зосима Воин, Федор Воин, Дмитрий Воин или Стратилат. Возможно, таким именем святого и нарекали младенцев, сделав старорусское имя Воин как бы крестильным, каноническим. Уменьшительное от него — Война, так и родилась фамилия Война.