Может быть, происхождение фамилии «Альшаков» связано с изменением в фамилии «Ольшаков» или «Ольшанский», буквы "О" на букву "А". Это могло произойти по той причине, что в устной речи слышится именно звук "А" в начале вышеуказанных фамилий. Фамилии Ольшанский и Ольшаков достаточно распространённые, происхождение фамилий связано с населённым пунктом Ольша.